Στόχος της ΒΙΟΚΥΚΛΟΣ ΦΑΡΜΑ είναι η παραγωγή υψηλής ποιότητας κρέατος με ελαχιστοποίηση ή και μηδενισμό των αποβλήτων σε όλα τα στάδια της παραγωγής. Βασική προϋπόθεση είναι η χρήση όλων των αποβλήτων της μονάδας αλλά και γεωργικών αποβλήτων από άλλες κτηνοτροφικές ή μεταποιητικές μονάδες (τυροκομία, ελαιοτριβεία κ.α.), ως παραγωγικών πόρων (βιοαέριο) και χρήσιμων υλικών (λίπασμα).

Η διαχείριση των αποβλήτων της μονάδας θα γίνει μέσω αναερόβιας χώνευσης. Η αναερόβια χώνευση είναι μια μικροβιολογική επεξεργασία η οποία πραγματοποιείται χωρίς παρουσία οξυγόνου και έχει σαν στόχο την μείωση του ποσοστού των οργανικών στερεών. Με τη διαδικασία της αναερόβιας χώνευσης επιτυγχάνεται παραγωγή βιοαερίου και εδαφοβελτιωτικών (υγρό λίπασμα και κομποστ).